据有关资料研究，结核杆菌在人体结核病灶内存在4种不同代谢状态的结核杆菌群，在不同环境下，对抗结核药物的反应各异。现表述如下：
A菌群（快速繁殖期，又称生长繁殖菌）特点是代谢相当旺盛，生长繁殖快，并常在细胞外，异烟肼对它的杀灭作用最强，其次是利福平和链霉素，此期引起的病变多为浸润渗出病灶，虽药物治疗效果好，但也含有少量天然耐药突变菌，应用一种药物后，敏感菌被杀灭，而耐药菌迅速生长成为优势菌群，易造成临床上病程一度好后又发生恶化，联合用药可起到交叉杀菌作用，能有效地防止此情出现。
B菌群：（慢速繁殖菌，又称间歇繁殖菌）即处于细胞内酸性环境中的半休眠菌，特点是大部分结核菌处于代谢低下或静止状态。一般抗结核药物不起作用或作用甚微，呲嗪酰胺、利福平对本群结核杆菌最有效，异烟肼也有一定作用。
C菌群（缓慢生长菌，又称胞内生长菌）它们在大多数时间中处于低代谢或半静止状态，但也可以在短时间内突发生长，特点是大部分结核杆菌处于氧分压低，酸性或营养不良等不利的情况下，结核杆菌的生长繁殖受到抑制，干酪病灶内细菌多属此类，链霉素无效、利福平对此菌有作用、呲嗪酰胺效果好。
D菌群：（全休眠菌群）结核杆菌完全处于休眠状态，几乎无有效药物使用，仅靠宿主本身的免疫机能来逐渐消除。
由于B菌群和C菌群可以在体内持续或长期存活，在一定条件下重新生长，繁殖，是结核病复发的根源，所以医学专家认为，消灭B菌群是实现灭菌目标，防止复发的关键。这就需要全程规则的用药。
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